Mines de Saint-Étienne Introduction au traitement et à l'analyse des images avec Python du Lundi 04 mai 2015 au Mardi 05 mai 2015

Introduction au traitement et à l'analyse des images avec Python

Lundi 4 mai, mardi 5 mai 2015

Cette formation vise à introduire les notions de base du traitement des images numériques à l'aide du langage python. Nous aborderons sur des cas concrets (images de microscopie optique, IRM, ...) des opérations élémentaires comme le filtrage par convolution (flou, augmentation des contrastes, détection des contours), ainsi que l'utilisation de principes et outils mathématiques comme la transformée de Fourier, les équations différentielles partielles, les espaces vectoriels ou l'algèbre.

• Pré-requis : stage ouvert aux enseignants de toutes disciplines. Niveau débutant en traitement d'images. Aucune connaissance spécifique avec le langage python n'est attendue (il faut néanmoins être à l'aise avec au moins un langage de programmation).

• Lieu : Ecole des Mines, 158 Cours Fauriel, Saint-Etienne.

•Les stagiaires pourront utiliser les ordinateurs de l’Ecole des Mines. Ils peuvent également utiliser leur propre matériel.

• Python sera utilisé sous Windows avec l'environnement de développement spyder (disponible également sous Linux et Mac).

• Moyens pédagogiques : séances sous forme de travaux dirigés, sur PC.

• Documents fournis : énoncés des TD, corrections et codes des corrections.

• Nombre de stagiaires : 30 maximum.

Logistique

Lieu : Ecole des Mines, 158 Cours Fauriel, 42100 Saint-Etienne.

Repas : les deux déjeuners et le repas du lundi soir 4 mai seront pris en charge par l'EMSE.

Logement (à la charge des stagiaires) :

• Possibilités à la maison des élèves (chambre 19€, studio 25€, petit déjeuner 5€). Tel : 04 77 42 93 00, administration-me@emse.fr

• Autres solutions à proximité :

• Hôtel Astoria, 5 min de l'EMSE à pied http://www.hotel-astoria.fr/

• Hôtel Continental, centre ville, 10 min par bus (ligne 6) http://www.hotelcontinental42.fr/

Incriptions et logistique : Marc ROELENS (roelens@emse.fr, 0477420173).

Inscription par email avant le lundi 20 avril 20h roelens@emse.fr

Intervenants et contacts

Yann GAVET, enseignant chercheur au LGF-CNRS (gavet@emse.fr, 0477420170).

Johan DEBAYLE, enseignant chercheur au LGF-CNRS (debayle@emse.fr, 0477420219).

Lundi 4 mai 2015 :

10h00 – 10h30 Accueil

10h30 – 12h30 Introduction (les bases des images numériques, les concepts, les modules python).

Prise en main des fonction élémentaires (chargement, affichage, histogramme)

Filtrage par convolution (flou, détection de contours, rehaussement des contours)

Filtres de rang (médian, minimum, maximum)

12h30 – 14h00 Déjeuner

14h00 – 15h30 Segmentation à base d'histogrammes

Seuillage de Otsu, K-moyennes.

15h30 – 16h00 Pause

16h00 – 17h30 Transformée de Fourier 2D

Utilisation pratiques

Application à l'évaluation de la densité cellulaire de l'endothélium cornéen humain

19h30 Diner à l’extérieur

Mardi 5 mai 2015 :

9h00 – 10h30 Modèle non-linéaire et espace vectoriel d'images

Rehaussement de la dynamique

Application à l'imagerie X (mammographies)

10h30 – 11h00 Pause

11h00 – 12h30 Équations différentielles partielles et filtrage

Application à des images d'IRM de cerveau humain

12h30 – 14h00 Déjeuner

14h00 – 16h00 Morphologie mathématique

Opérations élémentaires

Filtrage

Segmentation

16h00 – 16h30 Discussion, conclusion